現在、官公庁におけるシステム調達のルールとして、EAの策定のフェーズと、それに続くシステム構築（設計、開発）のフェーズを同一の業者が受注することを禁じている。
余談となるが、官公庁における多くのEAプロジェクトは「省」を対象としているのではなく、「省」の一段下の組織である「部局」の業務・システムを対象としたEAプロジェクトだ。
組織全体の業務効率化を図るのがEAの定義のひとつとすると、部局のみを対象とするプロジェクトが本当の意味でのEAといえるのか？等の指摘。経済産業省は「部局」もエンタープライズになりうるという定義はされているらしい。
